הצבעה שנתית- הנושאים שעמדו בהצלחה בכל הקריטריונים עולים להצבעה מקוונת, וחברי הלובי יכולים להצביע בעד הנושאים שהם מעוניינים שנקדם. החברים יכולים להצביע גם נגד נושא שהם אינם מעוניינים שנעסוק בו, וכל נושא שיקבל למעלה מ-25% התנגדות – ייפסל. הנושאים שיקבלו את מרב הקולות, תוך שקלול קולות הנגד – ייבחרו.
הצבעת נגד – אחת לשנתיים מתקיימת הצבעת חברים על גריעת נושא גג, שבה החברים יוכלו לבחור נושא מתוך רשימת הנושאים שלנו, שבו נפסיק לטפל, וזאת כדי לאפשר להוסיף נושאים חדשים בתוך מיצוי הנושאים הקיימים.

הצבעות קטנות – לאורך השנה מתקיימות 4-2 הצבעות קטנות בנושאי התוכן, המחקר, השיווק והמחלקה המשפטית, שבהן נבקש את הכרעת החברים בנושאים מיידים שעל סדר היום. לדוגמה: "האם לובי 99 צריך להגיש ערעור לבית המשפט על החלטת רשות התחרות לאשר את העסקה, שבמסגרתה מונופול הגז רוכש את צינור הגז בין ישראל למצרים?".

הצבעת תקציב – התקציב השנתי של המיזם מובא לאישור החברים בהצבעה. הצעת תקציב שתקבל 25% התנגדות ומעלה תיפסל, ותובא במקומה הצעה חלופית. חברי המיזם מאשרים את התקציב השנתי שלנו (בחודש דצמבר), אשר עולה לאחר מכן לאתר האינטרנט, והוא שקוף לכולם. בתקציב מפורטות כל הוצאות הארגון, החל משכר ועד הוצאות משרד.